Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PparaP23204 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PparaP23204 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PparaP23204 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PparaP23204 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PparaP23204 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PparaP23204 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PparaP23204 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PparaP23204 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PparaP23204 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PparaP23204 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PparaP23204 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PparaP23204 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PparaP23204 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PparaP23204 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PparaP23204 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PparaP23204 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PparaP23204 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PparaP23204 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PparaP23204 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PparaP23204 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PparaP23204 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PparaP23204 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PparaP23204 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PparaP23204 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PparaP23204 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms