Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gadd45bP22339 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gadd45bP22339 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gadd45bP22339 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gadd45bP22339 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms