Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcaP20444 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkcaP20444 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms