Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irf1P15314 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irf1P15314 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf1P15314 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf1P15314 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf1P15314 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf1P15314 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf1P15314 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf1P15314 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf1P15314 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf1P15314 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf1P15314 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf1P15314 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf1P15314 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf1P15314 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf1P15314 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf1P15314 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms