Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FosbP13346 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FosbP13346 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FosbP13346 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FosbP13346 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FosbP13346 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FosbP13346 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FosbP13346 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FosbP13346 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FosbP13346 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FosbP13346 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FosbP13346 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FosbP13346 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FosbP13346 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FosbP13346 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FosbP13346 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FosbP13346 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FosbP13346 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FosbP13346 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FosbP13346 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FosbP13346 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FosbP13346 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FosbP13346 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FosbP13346 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FosbP13346 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FosbP13346 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FosbP13346 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FosbP13346 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FosbP13346 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FosbP13346 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FosbP13346 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FosbP13346 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FosbP13346 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FosbP13346 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FosbP13346 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FosbP13346 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FosbP13346 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FosbP13346 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FosbP13346 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FosbP13346 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FosbP13346 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FosbP13346 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FosbP13346 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FosbP13346 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FosbP13346 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FosbP13346 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FosbP13346 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FosbP13346 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FosbP13346 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FosbP13346 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FosbP13346 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FosbP13346 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FosbP13346 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FosbP13346 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FosbP13346 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FosbP13346 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FosbP13346 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FosbP13346 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FosbP13346 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FosbP13346 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FosbP13346 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FosbP13346 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FosbP13346 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FosbP13346 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FosbP13346 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FosbP13346 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FosbP13346 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FosbP13346 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FosbP13346 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FosbP13346 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FosbP13346 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FosbP13346 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FosbP13346 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FosbP13346 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FosbP13346 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FosbP13346 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FosbP13346 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FosbP13346 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FosbP13346 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FosbP13346 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FosbP13346 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FosbP13346 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FosbP13346 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FosbP13346 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FosbP13346 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FosbP13346 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FosbP13346 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FosbP13346 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms