Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv4P11370 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv4P11370 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv4P11370 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv4P11370 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fv4P11370 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv4P11370 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv4P11370 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fv4P11370 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fv4P11370 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fv4P11370 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fv4P11370 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fv4P11370 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fv4P11370 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fv4P11370 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fv4P11370 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fv4P11370 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fv4P11370 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fv4P11370 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fv4P11370 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fv4P11370 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fv4P11370 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fv4P11370 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fv4P11370 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fv4P11370 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fv4P11370 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms