Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myod1P10085 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myod1P10085 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myod1P10085 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myod1P10085 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myod1P10085 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms