Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6c1P0CW02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6c1P0CW02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6c1P0CW02 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms