Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa9P09631 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa9P09631 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms