Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9P06683 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9P06683 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9P06683 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9P06683 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9P06683 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P06683 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P06683 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P06683 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P06683 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P06683 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P06683 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P06683 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P06683 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P06683 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P06683 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P06683 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P06683 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P06683 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P06683 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P06683 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P06683 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P06683 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P06683 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P06683 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P06683 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P06683 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P06683 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P06683 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P06683 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P06683 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P06683 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P06683 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P06683 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P06683 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P06683 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P06683 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P06683 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P06683 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9P06683 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9P06683 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9P06683 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9P06683 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9P06683 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9P06683 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9P06683 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9P06683 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9P06683 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9P06683 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9P06683 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9P06683 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9P06683 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9P06683 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9P06683 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9P06683 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9P06683 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9P06683 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9P06683 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9P06683 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9P06683 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9P06683 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9P06683 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9P06683 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9P06683 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9P06683 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9P06683 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9P06683 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9P06683 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9P06683 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9P06683 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9P06683 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9P06683 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9P06683 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9P06683 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9P06683 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9P06683 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms