Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tp53P02340 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tp53P02340 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53P02340 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53P02340 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53P02340 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tp53P02340 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tp53P02340 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53P02340 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53P02340 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53P02340 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tp53P02340 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tp53P02340 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53P02340 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53P02340 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tp53P02340 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53P02340 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms