Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01789 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01789 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01789 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01789 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01789 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01789 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01789 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01789 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01789 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01789 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01789 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01789 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01789 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01789 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01789 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01789 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01789 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01789 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01789 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01789 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01789 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01789 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01789 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01789 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01789 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01789 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01789 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01789 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01789 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01789 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01789 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01789 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01789 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01789 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01789 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01789 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01789 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01789 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01789 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01789 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01789 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01789 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01789 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01789 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01789 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01789 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01789 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01789 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01789 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01789 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01789 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01789 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01789 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01789 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01789 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01789 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01789 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01789 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01789 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01789 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01789 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01789 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01789 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P01789 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01789 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01789 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01789 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms