Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01724 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01724 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01724 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01724 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01724 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01724 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01724 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01724 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01724 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01724 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01724 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01724 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01724 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01724 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01724 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01724 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01724 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01724 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01724 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01724 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01724 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01724 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01724 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01724 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01724 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01724 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01724 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01724 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01724 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01724 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01724 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01724 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01724 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01724 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01724 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01724 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01724 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01724 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01724 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01724 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01724 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01724 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01724 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01724 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01724 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01724 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01724 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01724 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01724 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01724 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01724 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01724 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01724 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01724 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01724 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01724 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01724 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01724 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01724 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01724 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01724 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01724 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms