Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AvilO88398 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AvilO88398 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AvilO88398 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AvilO88398 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AvilO88398 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AvilO88398 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AvilO88398 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AvilO88398 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AvilO88398 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AvilO88398 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AvilO88398 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AvilO88398 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AvilO88398 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AvilO88398 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AvilO88398 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AvilO88398 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AvilO88398 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AvilO88398 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AvilO88398 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AvilO88398 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AvilO88398 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AvilO88398 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AvilO88398 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AvilO88398 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AvilO88398 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AvilO88398 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AvilO88398 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AvilO88398 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AvilO88398 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AvilO88398 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AvilO88398 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AvilO88398 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AvilO88398 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AvilO88398 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AvilO88398 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AvilO88398 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AvilO88398 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AvilO88398 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AvilO88398 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AvilO88398 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AvilO88398 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AvilO88398 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AvilO88398 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AvilO88398 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AvilO88398 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AvilO88398 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AvilO88398 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AvilO88398 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AvilO88398 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AvilO88398 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AvilO88398 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AvilO88398 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AvilO88398 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AvilO88398 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AvilO88398 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AvilO88398 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AvilO88398 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AvilO88398 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AvilO88398 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AvilO88398 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AvilO88398 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AvilO88398 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AvilO88398 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AvilO88398 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AvilO88398 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AvilO88398 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AvilO88398 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AvilO88398 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AvilO88398 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AvilO88398 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AvilO88398 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AvilO88398 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AvilO88398 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AvilO88398 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AvilO88398 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AvilO88398 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AvilO88398 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AvilO88398 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AvilO88398 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AvilO88398 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms