Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nid2O88322 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nid2O88322 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nid2O88322 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nid2O88322 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nid2O88322 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nid2O88322 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nid2O88322 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nid2O88322 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nid2O88322 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nid2O88322 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nid2O88322 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nid2O88322 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nid2O88322 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nid2O88322 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nid2O88322 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nid2O88322 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nid2O88322 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nid2O88322 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms