Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10509O88255 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm10509O88255 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm10509O88255 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms