Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd2O70572 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Smpd2O70572 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd2O70572 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd2O70572 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms