Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xirp1O70373 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Xirp1O70373 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xirp1O70373 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xirp1O70373 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms