Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nptx2O70340 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nptx2O70340 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nptx2O70340 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nptx2O70340 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms