Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FiglaO55208 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FiglaO55208 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FiglaO55208 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FiglaO55208 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FiglaO55208 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FiglaO55208 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FiglaO55208 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms