Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb2O55203 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ldb2O55203 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms