Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyp26a1O55127 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp26a1O55127 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp26a1O55127 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms