Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn20O55082 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpn20O55082 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn20O55082 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms