Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nck2O55033 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nck2O55033 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nck2O55033 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nck2O55033 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nck2O55033 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nck2O55033 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nck2O55033 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nck2O55033 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nck2O55033 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nck2O55033 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nck2O55033 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nck2O55033 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nck2O55033 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nck2O55033 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nck2O55033 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms