Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole2O54956 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole2O54956 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pole2O54956 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole2O54956 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pole2O54956 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pole2O54956 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pole2O54956 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pole2O54956 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pole2O54956 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pole2O54956 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pole2O54956 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pole2O54956 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pole2O54956 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pole2O54956 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms