Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1i2O54915 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nr1i2O54915 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1i2O54915 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1i2O54915 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1i2O54915 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms