Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd200O54901 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd200O54901 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd200O54901 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd200O54901 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd200O54901 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd200O54901 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200O54901 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd200O54901 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200O54901 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms