Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brs3O54798 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brs3O54798 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brs3O54798 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brs3O54798 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brs3O54798 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brs3O54798 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brs3O54798 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brs3O54798 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms