Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33bO35963 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33bO35963 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms