Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PnnO35691 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PnnO35691 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PnnO35691 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PnnO35691 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PnnO35691 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PnnO35691 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PnnO35691 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PnnO35691 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PnnO35691 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PnnO35691 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PnnO35691 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PnnO35691 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PnnO35691 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PnnO35691 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PnnO35691 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PnnO35691 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PnnO35691 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PnnO35691 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PnnO35691 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PnnO35691 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PnnO35691 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PnnO35691 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PnnO35691 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PnnO35691 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PnnO35691 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PnnO35691 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PnnO35691 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PnnO35691 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PnnO35691 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PnnO35691 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PnnO35691 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PnnO35691 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PnnO35691 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PnnO35691 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PnnO35691 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PnnO35691 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PnnO35691 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PnnO35691 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PnnO35691 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PnnO35691 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PnnO35691 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PnnO35691 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PnnO35691 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PnnO35691 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PnnO35691 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PnnO35691 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PnnO35691 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnnO35691 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnnO35691 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnnO35691 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnnO35691 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnnO35691 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnnO35691 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PnnO35691 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PnnO35691 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PnnO35691 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PnnO35691 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PnnO35691 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PnnO35691 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PnnO35691 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PnnO35691 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PnnO35691 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PnnO35691 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PnnO35691 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PnnO35691 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PnnO35691 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PnnO35691 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PnnO35691 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PnnO35691 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnnO35691 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms