Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NudcO35685 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NudcO35685 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NudcO35685 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NudcO35685 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NudcO35685 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NudcO35685 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NudcO35685 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NudcO35685 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NudcO35685 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NudcO35685 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NudcO35685 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NudcO35685 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NudcO35685 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NudcO35685 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NudcO35685 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NudcO35685 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NudcO35685 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NudcO35685 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NudcO35685 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NudcO35685 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NudcO35685 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NudcO35685 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NudcO35685 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NudcO35685 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NudcO35685 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NudcO35685 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NudcO35685 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NudcO35685 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NudcO35685 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NudcO35685 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NudcO35685 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NudcO35685 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NudcO35685 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NudcO35685 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NudcO35685 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NudcO35685 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NudcO35685 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NudcO35685 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NudcO35685 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NudcO35685 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NudcO35685 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NudcO35685 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NudcO35685 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NudcO35685 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NudcO35685 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NudcO35685 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NudcO35685 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NudcO35685 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NudcO35685 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NudcO35685 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NudcO35685 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NudcO35685 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NudcO35685 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NudcO35685 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NudcO35685 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NudcO35685 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NudcO35685 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NudcO35685 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NudcO35685 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NudcO35685 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NudcO35685 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NudcO35685 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NudcO35685 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NudcO35685 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NudcO35685 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NudcO35685 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NudcO35685 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NudcO35685 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NudcO35685 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NudcO35685 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NudcO35685 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NudcO35685 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NudcO35685 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NudcO35685 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NudcO35685 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms