Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Npc1O35604 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npc1O35604 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npc1O35604 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npc1O35604 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npc1O35604 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npc1O35604 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npc1O35604 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Npc1O35604 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npc1O35604 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms