Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rabep1O35551 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rabep1O35551 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rabep1O35551 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rabep1O35551 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rabep1O35551 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rabep1O35551 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rabep1O35551 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rabep1O35551 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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