Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CckarO08786 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CckarO08786 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CckarO08786 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CckarO08786 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CckarO08786 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CckarO08786 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CckarO08786 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CckarO08786 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CckarO08786 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CckarO08786 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CckarO08786 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CckarO08786 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CckarO08786 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CckarO08786 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CckarO08786 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CckarO08786 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CckarO08786 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CckarO08786 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CckarO08786 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CckarO08786 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CckarO08786 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CckarO08786 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CckarO08786 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CckarO08786 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CckarO08786 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CckarO08786 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CckarO08786 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CckarO08786 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CckarO08786 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CckarO08786 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CckarO08786 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CckarO08786 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CckarO08786 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CckarO08786 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CckarO08786 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CckarO08786 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CckarO08786 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CckarO08786 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CckarO08786 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CckarO08786 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CckarO08786 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CckarO08786 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CckarO08786 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CckarO08786 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CckarO08786 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CckarO08786 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CckarO08786 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CckarO08786 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CckarO08786 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CckarO08786 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CckarO08786 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CckarO08786 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CckarO08786 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CckarO08786 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CckarO08786 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CckarO08786 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CckarO08786 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CckarO08786 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CckarO08786 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CckarO08786 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CckarO08786 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CckarO08786 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CckarO08786 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CckarO08786 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CckarO08786 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CckarO08786 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CckarO08786 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms