Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3402K7N5P2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3402K7N5P2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3402K7N5P2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms