Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Gm21887J3QQ04 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21887J3QQ04 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21887J3QQ04 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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