Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccer2J3QPU5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccer2J3QPU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccer2J3QPU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccer2J3QPU5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccer2J3QPU5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms