Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm9602J3QPD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9602J3QPD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm9602J3QPD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm9602J3QPD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9602J3QPD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9602J3QPD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms