Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21972J3QN38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm21972J3QN38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm21972J3QN38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms