Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top6blJ3QMY9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top6blJ3QMY9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top6blJ3QMY9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms