Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip12G5E870 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip12G5E870 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trip12G5E870 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip12G5E870 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms