Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r34G3XA52 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r34G3XA52 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vmn1r34G3XA52 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms