Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Colca2F8VPY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Colca2F8VPY8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colca2F8VPY8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colca2F8VPY8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms