Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm340F6RGI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm340F6RGI3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms