Protein–RNA interactions for Protein: E9Q634

Myo1e, Unconventional myosin-Ie, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1eE9Q634 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1eE9Q634 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Myo1eE9Q634 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myo1eE9Q634 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo1eE9Q634 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myo1eE9Q634 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myo1eE9Q634 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms