Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd2E9Q5F9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Setd2E9Q5F9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Setd2E9Q5F9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms