Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup153E9Q3G8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup153E9Q3G8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nup153E9Q3G8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nup153E9Q3G8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup153E9Q3G8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms