Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cfap46E9Q2C0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20,72■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Cfap46E9Q2C0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Cfap46E9Q2C0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20,62■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20,62■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20,6■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cfap46E9Q2C0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20,58■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
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