Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3250E9Q1M3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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