Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Triml2E9PW10 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Triml2E9PW10 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Triml2E9PW10 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Triml2E9PW10 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Triml2E9PW10 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Triml2E9PW10 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms